Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB73

NDNF, Protein NDNF, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNFQ8TB73 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDNFQ8TB73 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDNFQ8TB73 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NDNFQ8TB73 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDNFQ8TB73 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDNFQ8TB73 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDNFQ8TB73 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDNFQ8TB73 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NDNFQ8TB73 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDNFQ8TB73 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDNFQ8TB73 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NDNFQ8TB73 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDNFQ8TB73 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NDNFQ8TB73 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDNFQ8TB73 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NDNFQ8TB73 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NDNFQ8TB73 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDNFQ8TB73 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NDNFQ8TB73 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDNFQ8TB73 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NDNFQ8TB73 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms