Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMO3Q8TAP4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMO3Q8TAP4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMO3Q8TAP4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMO3Q8TAP4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMO3Q8TAP4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMO3Q8TAP4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LMO3Q8TAP4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMO3Q8TAP4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMO3Q8TAP4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMO3Q8TAP4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMO3Q8TAP4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMO3Q8TAP4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMO3Q8TAP4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LMO3Q8TAP4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMO3Q8TAP4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMO3Q8TAP4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMO3Q8TAP4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMO3Q8TAP4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMO3Q8TAP4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMO3Q8TAP4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMO3Q8TAP4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMO3Q8TAP4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMO3Q8TAP4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMO3Q8TAP4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMO3Q8TAP4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMO3Q8TAP4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LMO3Q8TAP4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LMO3Q8TAP4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMO3Q8TAP4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms