Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATL2Q8NHH9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATL2Q8NHH9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms