Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG50

RDM1, RAD52 motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDM1Q8NG50 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RDM1Q8NG50 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RDM1Q8NG50 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RDM1Q8NG50 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RDM1Q8NG50 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RDM1Q8NG50 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RDM1Q8NG50 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RDM1Q8NG50 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RDM1Q8NG50 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RDM1Q8NG50 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RDM1Q8NG50 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RDM1Q8NG50 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RDM1Q8NG50 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RDM1Q8NG50 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RDM1Q8NG50 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RDM1Q8NG50 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RDM1Q8NG50 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RDM1Q8NG50 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RDM1Q8NG50 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RDM1Q8NG50 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RDM1Q8NG50 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RDM1Q8NG50 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RDM1Q8NG50 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RDM1Q8NG50 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RDM1Q8NG50 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RDM1Q8NG50 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RDM1Q8NG50 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RDM1Q8NG50 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms