Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBS3

SLC4A11, Sodium bicarbonate transporter-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A11Q8NBS3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A11Q8NBS3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A11Q8NBS3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC4A11Q8NBS3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC4A11Q8NBS3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A11Q8NBS3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A11Q8NBS3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A11Q8NBS3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A11Q8NBS3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A11Q8NBS3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A11Q8NBS3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A11Q8NBS3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A11Q8NBS3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A11Q8NBS3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A11Q8NBS3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A11Q8NBS3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A11Q8NBS3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A11Q8NBS3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A11Q8NBS3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A11Q8NBS3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A11Q8NBS3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A11Q8NBS3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A11Q8NBS3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A11Q8NBS3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A11Q8NBS3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A11Q8NBS3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.4 ms