Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZIC4Q8N9L1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZIC4Q8N9L1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms