Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER3Q8N944 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER3Q8N944 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER3Q8N944 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMER3Q8N944 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMER3Q8N944 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMER3Q8N944 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMER3Q8N944 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMER3Q8N944 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMER3Q8N944 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMER3Q8N944 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMER3Q8N944 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMER3Q8N944 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMER3Q8N944 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMER3Q8N944 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMER3Q8N944 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMER3Q8N944 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMER3Q8N944 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMER3Q8N944 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMER3Q8N944 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMER3Q8N944 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMER3Q8N944 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMER3Q8N944 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
AMER3Q8N944 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms