Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6T3

ARFGAP1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP1Q8N6T3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGAP1Q8N6T3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGAP1Q8N6T3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGAP1Q8N6T3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARFGAP1Q8N6T3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGAP1Q8N6T3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARFGAP1Q8N6T3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARFGAP1Q8N6T3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGAP1Q8N6T3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGAP1Q8N6T3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGAP1Q8N6T3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGAP1Q8N6T3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGAP1Q8N6T3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGAP1Q8N6T3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGAP1Q8N6T3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGAP1Q8N6T3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGAP1Q8N6T3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFGAP1Q8N6T3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFGAP1Q8N6T3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFGAP1Q8N6T3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFGAP1Q8N6T3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFGAP1Q8N6T3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFGAP1Q8N6T3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGAP1Q8N6T3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGAP1Q8N6T3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGAP1Q8N6T3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGAP1Q8N6T3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms