Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6N2

TTC9B, Tetratricopeptide repeat protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9BQ8N6N2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC9BQ8N6N2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC9BQ8N6N2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC9BQ8N6N2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC9BQ8N6N2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC9BQ8N6N2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC9BQ8N6N2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC9BQ8N6N2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC9BQ8N6N2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC9BQ8N6N2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC9BQ8N6N2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC9BQ8N6N2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC9BQ8N6N2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC9BQ8N6N2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC9BQ8N6N2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC9BQ8N6N2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC9BQ8N6N2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC9BQ8N6N2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC9BQ8N6N2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC9BQ8N6N2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC9BQ8N6N2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC9BQ8N6N2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTC9BQ8N6N2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC9BQ8N6N2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms