Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC155Q8N6L0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC155Q8N6L0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC155Q8N6L0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC155Q8N6L0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC155Q8N6L0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC155Q8N6L0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC155Q8N6L0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC155Q8N6L0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC155Q8N6L0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC155Q8N6L0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC155Q8N6L0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC155Q8N6L0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC155Q8N6L0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC155Q8N6L0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC155Q8N6L0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC155Q8N6L0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC155Q8N6L0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC155Q8N6L0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC155Q8N6L0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC155Q8N6L0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC155Q8N6L0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC155Q8N6L0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC155Q8N6L0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC155Q8N6L0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC155Q8N6L0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC155Q8N6L0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC155Q8N6L0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC155Q8N6L0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms