Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC33Q8N5R6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC33Q8N5R6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC33Q8N5R6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms