Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDCL2Q8N4E4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PDCL2Q8N4E4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDCL2Q8N4E4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCL2Q8N4E4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCL2Q8N4E4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms