Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFRP1Q8N474 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SFRP1Q8N474 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms