Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LNX2Q8N448 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms