Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3D4

EHBP1L1, EH domain-binding protein 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHBP1L1Q8N3D4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
EHBP1L1Q8N3D4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
EHBP1L1Q8N3D4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
EHBP1L1Q8N3D4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
EHBP1L1Q8N3D4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
EHBP1L1Q8N3D4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
EHBP1L1Q8N3D4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
EHBP1L1Q8N3D4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
EHBP1L1Q8N3D4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
EHBP1L1Q8N3D4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
EHBP1L1Q8N3D4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
EHBP1L1Q8N3D4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
EHBP1L1Q8N3D4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
EHBP1L1Q8N3D4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
EHBP1L1Q8N3D4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
EHBP1L1Q8N3D4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
EHBP1L1Q8N3D4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
EHBP1L1Q8N3D4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
EHBP1L1Q8N3D4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
EHBP1L1Q8N3D4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
EHBP1L1Q8N3D4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
EHBP1L1Q8N3D4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
EHBP1L1Q8N3D4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
EHBP1L1Q8N3D4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
EHBP1L1Q8N3D4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
EHBP1L1Q8N3D4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
EHBP1L1Q8N3D4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
EHBP1L1Q8N3D4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
EHBP1L1Q8N3D4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
EHBP1L1Q8N3D4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
EHBP1L1Q8N3D4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
EHBP1L1Q8N3D4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
EHBP1L1Q8N3D4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
EHBP1L1Q8N3D4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
EHBP1L1Q8N3D4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
EHBP1L1Q8N3D4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
EHBP1L1Q8N3D4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
EHBP1L1Q8N3D4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC37.02■■■■□ 3.52
EHBP1L1Q8N3D4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
EHBP1L1Q8N3D4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
EHBP1L1Q8N3D4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
EHBP1L1Q8N3D4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
EHBP1L1Q8N3D4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
EHBP1L1Q8N3D4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
EHBP1L1Q8N3D4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
EHBP1L1Q8N3D4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37■■■■□ 3.51
EHBP1L1Q8N3D4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
EHBP1L1Q8N3D4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC37■■■■□ 3.51
EHBP1L1Q8N3D4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
EHBP1L1Q8N3D4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
EHBP1L1Q8N3D4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC37■■■■□ 3.51
EHBP1L1Q8N3D4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
EHBP1L1Q8N3D4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
EHBP1L1Q8N3D4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC37■■■■□ 3.51
EHBP1L1Q8N3D4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
EHBP1L1Q8N3D4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
EHBP1L1Q8N3D4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
EHBP1L1Q8N3D4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
EHBP1L1Q8N3D4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
EHBP1L1Q8N3D4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
EHBP1L1Q8N3D4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
EHBP1L1Q8N3D4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
EHBP1L1Q8N3D4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
EHBP1L1Q8N3D4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
EHBP1L1Q8N3D4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
EHBP1L1Q8N3D4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
EHBP1L1Q8N3D4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms