Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2M8

CLASRP, CLK4-associating serine/arginine rich protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASRPQ8N2M8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CLASRPQ8N2M8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLASRPQ8N2M8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLASRPQ8N2M8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLASRPQ8N2M8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLASRPQ8N2M8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLASRPQ8N2M8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLASRPQ8N2M8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLASRPQ8N2M8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLASRPQ8N2M8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLASRPQ8N2M8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLASRPQ8N2M8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLASRPQ8N2M8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLASRPQ8N2M8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLASRPQ8N2M8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLASRPQ8N2M8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLASRPQ8N2M8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLASRPQ8N2M8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLASRPQ8N2M8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CLASRPQ8N2M8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLASRPQ8N2M8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLASRPQ8N2M8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLASRPQ8N2M8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLASRPQ8N2M8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLASRPQ8N2M8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CLASRPQ8N2M8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLASRPQ8N2M8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLASRPQ8N2M8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLASRPQ8N2M8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLASRPQ8N2M8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CLASRPQ8N2M8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLASRPQ8N2M8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLASRPQ8N2M8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLASRPQ8N2M8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLASRPQ8N2M8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms