Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLF2Q8IX21 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SLF2Q8IX21 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SLF2Q8IX21 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SLF2Q8IX21 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SLF2Q8IX21 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLF2Q8IX21 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLF2Q8IX21 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLF2Q8IX21 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLF2Q8IX21 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLF2Q8IX21 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SLF2Q8IX21 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SLF2Q8IX21 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SLF2Q8IX21 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLF2Q8IX21 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLF2Q8IX21 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLF2Q8IX21 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLF2Q8IX21 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLF2Q8IX21 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLF2Q8IX21 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLF2Q8IX21 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLF2Q8IX21 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLF2Q8IX21 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLF2Q8IX21 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLF2Q8IX21 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLF2Q8IX21 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLF2Q8IX21 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLF2Q8IX21 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms