Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVV2

LOXHD1, Lipoxygenase homology domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXHD1Q8IVV2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LOXHD1Q8IVV2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LOXHD1Q8IVV2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LOXHD1Q8IVV2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LOXHD1Q8IVV2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LOXHD1Q8IVV2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LOXHD1Q8IVV2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LOXHD1Q8IVV2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LOXHD1Q8IVV2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LOXHD1Q8IVV2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LOXHD1Q8IVV2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LOXHD1Q8IVV2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LOXHD1Q8IVV2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LOXHD1Q8IVV2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LOXHD1Q8IVV2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LOXHD1Q8IVV2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LOXHD1Q8IVV2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LOXHD1Q8IVV2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LOXHD1Q8IVV2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LOXHD1Q8IVV2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LOXHD1Q8IVV2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LOXHD1Q8IVV2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LOXHD1Q8IVV2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LOXHD1Q8IVV2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LOXHD1Q8IVV2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LOXHD1Q8IVV2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LOXHD1Q8IVV2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LOXHD1Q8IVV2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LOXHD1Q8IVV2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LOXHD1Q8IVV2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LOXHD1Q8IVV2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LOXHD1Q8IVV2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LOXHD1Q8IVV2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LOXHD1Q8IVV2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LOXHD1Q8IVV2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LOXHD1Q8IVV2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LOXHD1Q8IVV2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LOXHD1Q8IVV2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LOXHD1Q8IVV2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LOXHD1Q8IVV2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LOXHD1Q8IVV2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LOXHD1Q8IVV2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LOXHD1Q8IVV2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LOXHD1Q8IVV2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LOXHD1Q8IVV2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LOXHD1Q8IVV2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LOXHD1Q8IVV2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LOXHD1Q8IVV2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LOXHD1Q8IVV2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LOXHD1Q8IVV2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LOXHD1Q8IVV2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LOXHD1Q8IVV2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LOXHD1Q8IVV2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LOXHD1Q8IVV2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms