Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERC6Q8IVU3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERC6Q8IVU3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERC6Q8IVU3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC6Q8IVU3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HERC6Q8IVU3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms