Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUK5

PLXDC1, Plexin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXDC1Q8IUK5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXDC1Q8IUK5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLXDC1Q8IUK5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms