Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIBP1Q86W92 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIBP1Q86W92 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms