Protein–RNA interactions for Protein: Q7L4E1

MIGA2, Mitoguardin 2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIGA2Q7L4E1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MIGA2Q7L4E1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MIGA2Q7L4E1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MIGA2Q7L4E1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MIGA2Q7L4E1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MIGA2Q7L4E1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MIGA2Q7L4E1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MIGA2Q7L4E1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MIGA2Q7L4E1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MIGA2Q7L4E1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MIGA2Q7L4E1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MIGA2Q7L4E1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MIGA2Q7L4E1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MIGA2Q7L4E1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MIGA2Q7L4E1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MIGA2Q7L4E1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MIGA2Q7L4E1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MIGA2Q7L4E1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MIGA2Q7L4E1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MIGA2Q7L4E1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MIGA2Q7L4E1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MIGA2Q7L4E1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MIGA2Q7L4E1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MIGA2Q7L4E1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MIGA2Q7L4E1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MIGA2Q7L4E1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MIGA2Q7L4E1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MIGA2Q7L4E1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MIGA2Q7L4E1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MIGA2Q7L4E1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
MIGA2Q7L4E1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MIGA2Q7L4E1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MIGA2Q7L4E1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MIGA2Q7L4E1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MIGA2Q7L4E1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MIGA2Q7L4E1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MIGA2Q7L4E1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MIGA2Q7L4E1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MIGA2Q7L4E1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MIGA2Q7L4E1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MIGA2Q7L4E1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MIGA2Q7L4E1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MIGA2Q7L4E1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MIGA2Q7L4E1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MIGA2Q7L4E1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MIGA2Q7L4E1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MIGA2Q7L4E1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MIGA2Q7L4E1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MIGA2Q7L4E1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MIGA2Q7L4E1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms