Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SV2BQ7L1I2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SV2BQ7L1I2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SV2BQ7L1I2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms