Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
HECW1Q76N89 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
HECW1Q76N89 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
HECW1Q76N89 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
HECW1Q76N89 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
HECW1Q76N89 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
HECW1Q76N89 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
HECW1Q76N89 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
HECW1Q76N89 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
HECW1Q76N89 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
HECW1Q76N89 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
HECW1Q76N89 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
HECW1Q76N89 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
HECW1Q76N89 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
HECW1Q76N89 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC37.76■■■■□ 3.63
HECW1Q76N89 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
HECW1Q76N89 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
HECW1Q76N89 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
HECW1Q76N89 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
HECW1Q76N89 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
HECW1Q76N89 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
HECW1Q76N89 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC37.74■■■■□ 3.63
HECW1Q76N89 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
HECW1Q76N89 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
HECW1Q76N89 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
HECW1Q76N89 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
HECW1Q76N89 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
HECW1Q76N89 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
HECW1Q76N89 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
HECW1Q76N89 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
HECW1Q76N89 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
HECW1Q76N89 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
HECW1Q76N89 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
HECW1Q76N89 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
HECW1Q76N89 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC37.7■■■■□ 3.63
HECW1Q76N89 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
HECW1Q76N89 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
HECW1Q76N89 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
HECW1Q76N89 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
HECW1Q76N89 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
HECW1Q76N89 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
HECW1Q76N89 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
HECW1Q76N89 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
HECW1Q76N89 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
HECW1Q76N89 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
HECW1Q76N89 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
HECW1Q76N89 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
HECW1Q76N89 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
HECW1Q76N89 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
HECW1Q76N89 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
HECW1Q76N89 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
HECW1Q76N89 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
HECW1Q76N89 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
HECW1Q76N89 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
HECW1Q76N89 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
HECW1Q76N89 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
HECW1Q76N89 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
HECW1Q76N89 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
HECW1Q76N89 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
HECW1Q76N89 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
HECW1Q76N89 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
HECW1Q76N89 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
HECW1Q76N89 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
HECW1Q76N89 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
HECW1Q76N89 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC37.62■■■■□ 3.61
HECW1Q76N89 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
HECW1Q76N89 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
HECW1Q76N89 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
HECW1Q76N89 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
HECW1Q76N89 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
HECW1Q76N89 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
HECW1Q76N89 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
HECW1Q76N89 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
HECW1Q76N89 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
HECW1Q76N89 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
HECW1Q76N89 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
HECW1Q76N89 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
HECW1Q76N89 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
HECW1Q76N89 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
HECW1Q76N89 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
HECW1Q76N89 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
HECW1Q76N89 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
HECW1Q76N89 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
HECW1Q76N89 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
HECW1Q76N89 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
HECW1Q76N89 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
HECW1Q76N89 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC37.56■■■■□ 3.6
HECW1Q76N89 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
HECW1Q76N89 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
HECW1Q76N89 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
HECW1Q76N89 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
HECW1Q76N89 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
HECW1Q76N89 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
HECW1Q76N89 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
HECW1Q76N89 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
HECW1Q76N89 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
HECW1Q76N89 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
HECW1Q76N89 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
HECW1Q76N89 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
HECW1Q76N89 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms