Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC2

LARP4, La-related protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4Q71RC2 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.492e-10■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 NEDD8-MDP1-203ENST00000604306 681 ntTSL 511.99□□□□□ -0.492e-13■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PLD3-212ENST00000486134 327 ntTSL 211.93□□□□□ -0.52e-14■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 NLRP1-202ENST00000269280 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.59e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.519e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TBRG4-209ENST00000478532 945 ntTSL 511.85□□□□□ -0.519e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 RPL37-206ENST00000511787 435 ntTSL 311.84□□□□□ -0.519e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 DDX27-206ENST00000618172 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.529e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 HBP1-213ENST00000497535 702 ntTSL 211.81□□□□□ -0.529e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 HBP1-206ENST00000468116 579 ntTSL 411.81□□□□□ -0.529e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ELP4-211ENST00000638508 2163 ntTSL 511.74□□□□□ -0.539e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ELP4-207ENST00000638347 1651 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.539e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 SLC25A21-205ENST00000557611 591 ntTSL 511.68□□□□□ -0.549e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PSMD1-201ENST00000308696 3326 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.554e-10■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.559e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ZC3H3-201ENST00000262577 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.559e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.569e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AHI1-215ENST00000531788 3655 ntTSL 211.48□□□□□ -0.579e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 RCHY1-201ENST00000324439 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.579e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.589e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 NLRP1-208ENST00000571451 5444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.589e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 IDH1-201ENST00000345146 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.599e-10■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ATXN7L3B-201ENST00000519948 7604 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.599e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.69e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TTC32-202ENST00000402414 735 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.69e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 DDX27-201ENST00000371764 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.69e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AC241952.1-201ENST00000612480 6897 ntBASIC11.25□□□□□ -0.619e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 CUL1-203ENST00000602748 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.619e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 IDH1-208ENST00000481557 556 ntTSL 211.06□□□□□ -0.649e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AKT1-212ENST00000555380 534 ntTSL 411.05□□□□□ -0.649e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PIR-204ENST00000476381 904 ntTSL 311.05□□□□□ -0.649e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AKT1-202ENST00000402615 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.649e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ELP4-208ENST00000638376 1096 ntTSL 511.03□□□□□ -0.649e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 CREBBP-202ENST00000382070 7598 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.659e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 UBE2O-204ENST00000587127 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)10.9□□□□□ -0.669e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 EIF3K-213ENST00000593149 760 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.679e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PPME1-202ENST00000398427 2496 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AC009271.1-201ENST00000589440 518 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.689e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 SLC25A21-201ENST00000331299 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.699e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 POLE-213ENST00000539357 364 ntTSL 310.71□□□□□ -0.699e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 FANCI-214ENST00000567996 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.719e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ELP4-210ENST00000638482 3084 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.739e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 CCM2-213ENST00000480658 1136 ntTSL 210.45□□□□□ -0.749e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 POLE-210ENST00000537064 8011 ntTSL 1 (best)10.43□□□□□ -0.749e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 SUPT16H-207ENST00000557394 2324 ntTSL 210.4□□□□□ -0.742e-10■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AFDN-207ENST00000400822 7593 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.759e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ELP4-218ENST00000639570 5795 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.759e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 NLRP1-201ENST00000262467 5131 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.759e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 DDX27-207ENST00000622530 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.759e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 C1orf52-201ENST00000294661 3391 ntTSL 1 (best)10.32□□□□□ -0.769e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PTP4A2-211ENST00000528840 456 ntTSL 210.28□□□□□ -0.769e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ASCC3-204ENST00000369162 8146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.789e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 NEDD8-204ENST00000526430 286 ntTSL 310.14□□□□□ -0.793e-13■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 NEDD8-205ENST00000527046 847 ntTSL 210.14□□□□□ -0.792e-13■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AHI1-202ENST00000327035 3638 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.799e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 RFWD2-203ENST00000367667 2034 ntTSL 1 (best)10.06□□□□□ -0.89e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 EIF3K-214ENST00000614624 780 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.839e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 CUL1-202ENST00000409469 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.849e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 OTUD7B-202ENST00000581312 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.869e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 NEDD8-202ENST00000396828 626 ntTSL 29.61□□□□□ -0.872e-13■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 NLRP1-216ENST00000617618 4788 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.879e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 NLRP1-203ENST00000345221 4656 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.889e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 NLRP1-217ENST00000619223 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.889e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 KLHDC4-213ENST00000564484 562 ntTSL 59.57□□□□□ -0.889e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PIBF1-201ENST00000326291 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.889e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ELP4-227ENST00000640921 2721 ntTSL 29.52□□□□□ -0.899e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TRPM7-207ENST00000560955 7218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.899e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AL354740.1-201ENST00000586726 2681 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.99e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 NLRP1-215ENST00000613500 4494 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.919e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 CCM2-208ENST00000476594 533 ntTSL 39.36□□□□□ -0.919e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PPME1-209ENST00000544401 488 ntTSL 49.36□□□□□ -0.911e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 EIF3K-208ENST00000588934 501 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.949e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AFDN-204ENST00000366809 4839 ntTSL 1 (best)9.08□□□□□ -0.969e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 NLRP1-210ENST00000572272 4422 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.969e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.972e-13■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 NLRP1-204ENST00000354411 4332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.989e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 FANCI-207ENST00000564636 777 ntTSL 38.9□□□□□ -0.989e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 NLRP1-214ENST00000577119 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.999e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 NLRP1-207ENST00000571307 4050 ntTSL 1 (best)8.77□□□□□ -19e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 OSBPL8-215ENST00000552178 269 ntTSL 38.77□□□□□ -1.019e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 EIF3K-201ENST00000248342 864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.019e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 IGSF1-205ENST00000370904 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.012e-10■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 CCM2-210ENST00000478169 542 ntTSL 48.7□□□□□ -1.029e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PIBF1-207ENST00000615625 1098 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.029e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 EIF3K-211ENST00000592558 670 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.029e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 HUWE1-204ENST00000426907 4805 ntTSL 58.64□□□□□ -1.037e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 SUPT16H-201ENST00000216297 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.032e-10■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TTC32-201ENST00000333610 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.049e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TRIM66-208ENST00000531498 1210 ntTSL 1 (best)8.5□□□□□ -1.059e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AL354740.1-202ENST00000612837 290 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.069e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 IMMP2L-208ENST00000487733 580 ntTSL 28.45□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TRIM66-201ENST00000299550 9753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.069e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ELP4-215ENST00000638984 1330 ntTSL 58.35□□□□□ -1.079e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TMEM135-203ENST00000525018 753 ntTSL 58.34□□□□□ -1.079e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 NEDD8-206ENST00000531430 651 ntTSL 28.33□□□□□ -1.082e-13■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 471 ntTSL 28.13□□□□□ -1.112e-13■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TBRG4-206ENST00000475893 579 ntTSL 48□□□□□ -1.139e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AC010536.2-201ENST00000563036 338 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.139e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 DDX27-203ENST00000471144 3639 ntTSL 1 (best)7.89□□□□□ -1.159e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PIBF1-208ENST00000617689 2882 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.159e-6■■■■■ 29.6
Retrieved 100 of 15,922 protein–RNA pairs in 48.1 ms