Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRC1

C4orf50, Uncharacterized protein C4orf50, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf50Q6ZRC1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
C4orf50Q6ZRC1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C4orf50Q6ZRC1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4orf50Q6ZRC1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4orf50Q6ZRC1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4orf50Q6ZRC1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4orf50Q6ZRC1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4orf50Q6ZRC1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4orf50Q6ZRC1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4orf50Q6ZRC1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4orf50Q6ZRC1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4orf50Q6ZRC1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4orf50Q6ZRC1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4orf50Q6ZRC1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4orf50Q6ZRC1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4orf50Q6ZRC1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4orf50Q6ZRC1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4orf50Q6ZRC1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4orf50Q6ZRC1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4orf50Q6ZRC1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4orf50Q6ZRC1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4orf50Q6ZRC1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4orf50Q6ZRC1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4orf50Q6ZRC1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4orf50Q6ZRC1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4orf50Q6ZRC1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
C4orf50Q6ZRC1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4orf50Q6ZRC1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4orf50Q6ZRC1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms