Protein–RNA interactions for Protein: Q6WKZ4

RAB11FIP1, Rab11 family-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP1Q6WKZ4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAB11FIP1Q6WKZ4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB11FIP1Q6WKZ4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB11FIP1Q6WKZ4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB11FIP1Q6WKZ4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB11FIP1Q6WKZ4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB11FIP1Q6WKZ4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB11FIP1Q6WKZ4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB11FIP1Q6WKZ4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11FIP1Q6WKZ4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11FIP1Q6WKZ4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11FIP1Q6WKZ4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11FIP1Q6WKZ4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11FIP1Q6WKZ4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP1Q6WKZ4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP1Q6WKZ4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP1Q6WKZ4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP1Q6WKZ4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP1Q6WKZ4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP1Q6WKZ4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP1Q6WKZ4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP1Q6WKZ4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP1Q6WKZ4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP1Q6WKZ4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB11FIP1Q6WKZ4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB11FIP1Q6WKZ4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms