Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00575Q6W349 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00575Q6W349 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00575Q6W349 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00575Q6W349 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00575Q6W349 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00575Q6W349 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00575Q6W349 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00575Q6W349 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00575Q6W349 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00575Q6W349 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00575Q6W349 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00575Q6W349 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00575Q6W349 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00575Q6W349 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00575Q6W349 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00575Q6W349 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00575Q6W349 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00575Q6W349 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00575Q6W349 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00575Q6W349 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00575Q6W349 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms