Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VITQ6UXI7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VITQ6UXI7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VITQ6UXI7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VITQ6UXI7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VITQ6UXI7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VITQ6UXI7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VITQ6UXI7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VITQ6UXI7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VITQ6UXI7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VITQ6UXI7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VITQ6UXI7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VITQ6UXI7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VITQ6UXI7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VITQ6UXI7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VITQ6UXI7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VITQ6UXI7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VITQ6UXI7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VITQ6UXI7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VITQ6UXI7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VITQ6UXI7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VITQ6UXI7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VITQ6UXI7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VITQ6UXI7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VITQ6UXI7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VITQ6UXI7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VITQ6UXI7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VITQ6UXI7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VITQ6UXI7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VITQ6UXI7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VITQ6UXI7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VITQ6UXI7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VITQ6UXI7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VITQ6UXI7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VITQ6UXI7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VITQ6UXI7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VITQ6UXI7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VITQ6UXI7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VITQ6UXI7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VITQ6UXI7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VITQ6UXI7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VITQ6UXI7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VITQ6UXI7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VITQ6UXI7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VITQ6UXI7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VITQ6UXI7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VITQ6UXI7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VITQ6UXI7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VITQ6UXI7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VITQ6UXI7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VITQ6UXI7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VITQ6UXI7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VITQ6UXI7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VITQ6UXI7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VITQ6UXI7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms