Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CXCL17Q6UXB2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CXCL17Q6UXB2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CXCL17Q6UXB2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CXCL17Q6UXB2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CXCL17Q6UXB2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXCL17Q6UXB2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXCL17Q6UXB2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXCL17Q6UXB2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXCL17Q6UXB2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXCL17Q6UXB2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXCL17Q6UXB2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXCL17Q6UXB2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXCL17Q6UXB2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXCL17Q6UXB2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXCL17Q6UXB2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXCL17Q6UXB2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXCL17Q6UXB2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CXCL17Q6UXB2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CXCL17Q6UXB2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CXCL17Q6UXB2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CXCL17Q6UXB2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CXCL17Q6UXB2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CXCL17Q6UXB2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CXCL17Q6UXB2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CXCL17Q6UXB2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CXCL17Q6UXB2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CXCL17Q6UXB2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CXCL17Q6UXB2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXCL17Q6UXB2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXCL17Q6UXB2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXCL17Q6UXB2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXCL17Q6UXB2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXCL17Q6UXB2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXCL17Q6UXB2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CXCL17Q6UXB2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CXCL17Q6UXB2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CXCL17Q6UXB2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXCL17Q6UXB2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CXCL17Q6UXB2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CXCL17Q6UXB2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CXCL17Q6UXB2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CXCL17Q6UXB2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CXCL17Q6UXB2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CXCL17Q6UXB2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CXCL17Q6UXB2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CXCL17Q6UXB2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXCL17Q6UXB2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXCL17Q6UXB2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXCL17Q6UXB2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXCL17Q6UXB2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXCL17Q6UXB2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CXCL17Q6UXB2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CXCL17Q6UXB2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CXCL17Q6UXB2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CXCL17Q6UXB2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CXCL17Q6UXB2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CXCL17Q6UXB2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CXCL17Q6UXB2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms