Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWH4

FAM198B, Protein FAM198B, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM198BQ6UWH4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM198BQ6UWH4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms