Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
ZBED9Q6R2W3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
ZBED9Q6R2W3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ZBED9Q6R2W3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms