Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC137Q6PK04 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC137Q6PK04 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms