Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC174Q6PII3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC174Q6PII3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC174Q6PII3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC174Q6PII3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC174Q6PII3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC174Q6PII3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC174Q6PII3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC174Q6PII3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC174Q6PII3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC174Q6PII3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC174Q6PII3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC174Q6PII3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC174Q6PII3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC174Q6PII3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC174Q6PII3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC174Q6PII3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC174Q6PII3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC174Q6PII3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC174Q6PII3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC174Q6PII3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC174Q6PII3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC174Q6PII3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC174Q6PII3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC174Q6PII3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC174Q6PII3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC174Q6PII3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC174Q6PII3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC174Q6PII3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC174Q6PII3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC174Q6PII3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms