Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEK5Q6P3R8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEK5Q6P3R8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEK5Q6P3R8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEK5Q6P3R8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEK5Q6P3R8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEK5Q6P3R8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms