Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDC42EP5Q6NZY7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDC42EP5Q6NZY7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDC42EP5Q6NZY7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDC42EP5Q6NZY7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDC42EP5Q6NZY7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDC42EP5Q6NZY7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDC42EP5Q6NZY7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDC42EP5Q6NZY7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDC42EP5Q6NZY7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CDC42EP5Q6NZY7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CDC42EP5Q6NZY7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDC42EP5Q6NZY7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDC42EP5Q6NZY7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDC42EP5Q6NZY7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDC42EP5Q6NZY7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDC42EP5Q6NZY7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CDC42EP5Q6NZY7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDC42EP5Q6NZY7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDC42EP5Q6NZY7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDC42EP5Q6NZY7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDC42EP5Q6NZY7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDC42EP5Q6NZY7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CDC42EP5Q6NZY7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDC42EP5Q6NZY7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDC42EP5Q6NZY7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDC42EP5Q6NZY7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC42EP5Q6NZY7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDC42EP5Q6NZY7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDC42EP5Q6NZY7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDC42EP5Q6NZY7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms