Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRPF40BQ6NWY9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRPF40BQ6NWY9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRPF40BQ6NWY9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRPF40BQ6NWY9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRPF40BQ6NWY9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRPF40BQ6NWY9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRPF40BQ6NWY9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRPF40BQ6NWY9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRPF40BQ6NWY9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRPF40BQ6NWY9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRPF40BQ6NWY9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRPF40BQ6NWY9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRPF40BQ6NWY9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRPF40BQ6NWY9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRPF40BQ6NWY9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRPF40BQ6NWY9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRPF40BQ6NWY9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PRPF40BQ6NWY9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRPF40BQ6NWY9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRPF40BQ6NWY9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRPF40BQ6NWY9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PRPF40BQ6NWY9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms