Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCN10Q6JVE6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCN10Q6JVE6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCN10Q6JVE6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCN10Q6JVE6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCN10Q6JVE6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCN10Q6JVE6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCN10Q6JVE6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCN10Q6JVE6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCN10Q6JVE6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCN10Q6JVE6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCN10Q6JVE6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCN10Q6JVE6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LCN10Q6JVE6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCN10Q6JVE6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCN10Q6JVE6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCN10Q6JVE6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms