Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms