Protein–RNA interactions for Protein: Q6FI13

HIST2H2AA3, Histone H2A type 2-A, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2AA3Q6FI13 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIST2H2AA3Q6FI13 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIST2H2AA3Q6FI13 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIST2H2AA3Q6FI13 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms