Protein–RNA interactions for Protein: Q68D06

SLFN13, Schlafen family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN13Q68D06 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLFN13Q68D06 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLFN13Q68D06 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms