Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHEQ5VZ18 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHEQ5VZ18 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHEQ5VZ18 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms