Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYY2

LIPM, Lipase member M, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPMQ5VYY2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIPMQ5VYY2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIPMQ5VYY2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIPMQ5VYY2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms