Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QL3Q5VWW1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
C1QL3Q5VWW1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QL3Q5VWW1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms