Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM164Q5U3C3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM164Q5U3C3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms