Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAMD5Q5TGI4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms