Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAB7

RIPPLY2, Protein ripply2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY2Q5TAB7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIPPLY2Q5TAB7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms