Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRAPPC3LQ5T215 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRAPPC3LQ5T215 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRAPPC3LQ5T215 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRAPPC3LQ5T215 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRAPPC3LQ5T215 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
TRAPPC3LQ5T215 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.49
TRAPPC3LQ5T215 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
TRAPPC3LQ5T215 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TRAPPC3LQ5T215 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRAPPC3LQ5T215 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRAPPC3LQ5T215 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRAPPC3LQ5T215 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
TRAPPC3LQ5T215 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRAPPC3LQ5T215 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRAPPC3LQ5T215 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRAPPC3LQ5T215 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRAPPC3LQ5T215 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRAPPC3LQ5T215 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRAPPC3LQ5T215 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRAPPC3LQ5T215 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRAPPC3LQ5T215 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRAPPC3LQ5T215 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRAPPC3LQ5T215 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRAPPC3LQ5T215 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRAPPC3LQ5T215 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRAPPC3LQ5T215 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRAPPC3LQ5T215 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRAPPC3LQ5T215 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TRAPPC3LQ5T215 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
TRAPPC3LQ5T215 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRAPPC3LQ5T215 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRAPPC3LQ5T215 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRAPPC3LQ5T215 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms