Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTC39AQ5SRH9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTC39AQ5SRH9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TTC39AQ5SRH9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTC39AQ5SRH9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TTC39AQ5SRH9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTC39AQ5SRH9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTC39AQ5SRH9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TTC39AQ5SRH9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TTC39AQ5SRH9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TTC39AQ5SRH9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TTC39AQ5SRH9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TTC39AQ5SRH9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TTC39AQ5SRH9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TTC39AQ5SRH9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TTC39AQ5SRH9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TTC39AQ5SRH9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TTC39AQ5SRH9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TTC39AQ5SRH9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TTC39AQ5SRH9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TTC39AQ5SRH9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TTC39AQ5SRH9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TTC39AQ5SRH9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TTC39AQ5SRH9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TTC39AQ5SRH9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms