Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATAT1Q5SQI0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATAT1Q5SQI0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms